发生子宫内膜异位症的原因目前尚不够清楚，不过已经日益得到外医师对这种疾病的重视。根据子宫内膜异位症为良性病变，却具有向远处转移和种植子宫内膜的能力，现在有以下几种学说解释其发生的原出。
发生子宫内膜异位症的原因
(1)子宫内膜种植学说：通过各种途径都可造戊子宫内膜种植，如月经血逆流将脱落的子宫内膜碎屑，经输卵管带入卵巢表面或盆腔其他部位并在该处种植，可发生于几天性宫颈狭窄或阴道闭锁等经血外流不畅的思各;人工流产时负压过大或多次人工流产各。此外，临床发现由刮宫产手术后形成的腹壁切口处癌痕包块，其内容绝大多数为异位的子宫内膜所形成，这种医源性疾病也是种植学说的有力证明。
(2)体腔上皮化生学说：卵巢上皮、盆腔腹膜等组织都是由具有高度化生潜能的体腔上皮分化而来，在反复经血逆流、慢性炎症刺激或长期而持续的卵巢激素作用下，可被激活而转化以为子宫内腥。
(3)淋巴及静脉波散学说：在远离盆腔部位的器官，如肺、胸膜等处也偶然可见异位的子宫内膜生长，有人认为这可能是子宫内胶碎屑通过淋巴或静脉血管波散的结果。
类似的说法还有很多，不过大多数学者倾向于不能用单一的理由解释，出为现在还有很多研究证实，异位的内胶可由于细胞免疫缺陷及内分泌失调或可能有基出遗传等原出而发生，因而倾向于是通过多途径造成。
